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同学好
因为这个其实不是一个完整的句子
假如中文里你说“要是我会飞就好了！”
其实这也是一个从句（假如我会飞）+一个主句（(那)就好了）
【当然我这只是从解释德语句子的角度来类比，汉语本身肯定是不这么去分析的】
但是德语里你可以看到人们只用从句那部分进行感叹表达，所以
Wenn ich doch fliegen könnte！是一个不完整的句子，他其实就只是一个从句，一个wenn引导的从句。

然后，在此基础上，德语中条件从句可以用另一种形式来等价表达：
那就是把变为动词提到第一位置
比如Wenn es regnet, bleiben wir zu Hause
你也可以说Regner es, bleiben wir zu Hause.

长话短说
第一件事：非现实愿望句子本质上就是用一个wenn从句去进行感叹，它甚至都不是一个完整的句子，因为没有主句。只有wenn从句那一部分。
第二件事：wenn从句也可以用另一种形式，即变位动词直接提到句子第一成分，来表达，二者等价
综上：你看到了“非现实愿望句的语序为什么不是主语在第一位”的情况。