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同学你好
損なう和損ねる 这两个词的意思是一样的
后者更加口语，前者更加书面语一点

2个单词意思一样还能互换的话，为什么要造2个不同写法的词呢？
2个词很接近的情况，一般是一对 自他动词
比如说
人が集まる　　人聚集在一起，描述的是一个状态
人を集める 把人聚集在一起，强调动作，且暗含着某个人做聚集这个动作

以上供参考，如有疑问，请按追问
祝学习进步