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同学你好~~
1. 这句话助助觉得不大对，表达的意思和中文不一样，应该是少了半句
这里under是介词，表达在……之下的
如果要表达这个意思，可写为：
The company under the Guangzhou University of Traditional Chinese Medicine dependent large pharmacy chain and pharmaceutical Ltd. owns 11 stores.
整个the Guangzhou University of Traditional Chinese Medicine dependent large pharmacy chain and pharmaceutical Ltd. 就是这个广州中医药大学大药房养和医药连锁有限公司的全称

2. 一般可以用subordinate to
例如：
The research institute is subordinate to that university.
这个研究所从属于那所大学。

祝学习愉快~