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同学好：
that lay below 是定语从句，修饰mountains；“位于飞机下方的群山”。
that 在定语从句里做主语，不可以省略。

整个句子是包含有定语从句的复合句；
主句是 Byrd and his men were able to take a great many photographs of mountains；伯德和他的助手们能够拍下很多群山的照片；
定语从句是 that lay below ，修饰mountians，横亘于（位于）飞机之下的群山。

祝学习愉快！